T-COFFEE, Version_11.00 (Version_11.00)
Cedric Notredame
CPU TIME:0 sec.
SCORE=1000
*
B A D A V G G OOD
*
sequence1 : 100
sequence2 : 100
1cms : 100
sequence4 : 100
4pep : 100
cons : 100
sequence1 -STGSATTTPIDS-L-DDAYITPVQIGTPAQTLNLDFDTGSSDLWVFSSETTASEVDGQTIYTPSKSTTAKLLSGATWSISYGDGS-SSSGDVYTDTVSVGGLTVTGQAVESAKKVSSSFTEDSTIDGLLGLAFSTLNTVSPTQQKTFFD
sequence2 AASGVATNTPTAN---DEEYITPVTIG--GTTLNLNFDTGSADLWVFSTELPASQQSGHSVYNP--SATGKELSGYTWSISYGDGS-SASGNVFTDSVTVGGVTAHGQAVQAAQQISAQFQQDTNNDGLLGLAFSSINTVQPQSQTTFFD
1cms ---GEVASVPLTNYL-DSQYFGKIYLGTPPQEFTVLFDTGSSDFWVPSIYCKSNACKNHQRFDPRKSSTFQNL-GKPLSIHYGTGS-MQ-GILGYDTVTVSNIVDIQQTVGLSTQEPGDVFTYAEFDGILGMAYPSLAS---EYSIPVFD
sequence4 ---AGVGTVPMTDYGNDIEYYGQVTIGTPGKKFNLDFDTGSSDLWIASTLCTNCG-SGQTKYDPNQSSTYQAD-GRTWSISYGDGSSAS-GILAKDNVNLGGLLIKGQTIELAKREAASFAS-GPNDGLLGLGFDTITT--VRGVKTPMD
4pep -----IGDEPLENYL-DTEYFGTIGIGTPAQDFTVIFDTGSSNLWVPSVYCSSLACSDHNQFNPDDSSTFEAT-SQELSITYGTGS-MT-GILGYDTVQVGGISDTNQIFGLSETEPGSFLYYAPFDGILGLAYPSISA---SGATPVFD
cons * . * * : :* :.: *****:::*: * ..: : * *:* : . ** ** ** * : *.* :..: * . : .... **:**:.: :: : . :*
sequence1 NA--KASLDSPVFTADL--GYH-APGTYNFGFIDTTA
sequence2 TV--KSSLAQPLFAVAL--KHQ-QPGVYDFGFIDSSK
1cms NMMNRHLVAQDLFSVYMD-RNG-QESMLTLGAIDPSY
sequence4 NLISQGLISRPIFGVYLGKAKNGGGGEYIFGGYDSTK
4pep NLWDQGLVSQDLFSVYLS-SNDDSGSVVLLGGIDSSY
cons . : : :* . : . :* *.: