#!/bin/sh
if test ! -d $outdir
then
    mkdir $outdir
fi

/usr/bin/srf2fasta $srcdir/data/proc.srf > $outdir/slx.fasta
cmp $outdir/slx.fasta $srcdir/data/slx.fasta || exit 1
/usr/bin/srf2fasta -C $srcdir/data/proc.srf > $outdir/slx.fasta
cmp $outdir/slx.fasta $srcdir/data/slx-C.fasta || exit 1

/usr/bin/srf2fasta $srcdir/data/raw.srf > $outdir/slx.fasta
cmp $outdir/slx.fasta $srcdir/data/slx.fasta || exit 1
/usr/bin/srf2fasta -C $srcdir/data/raw.srf > $outdir/slx.fasta
cmp $outdir/slx.fasta $srcdir/data/slx-C.fasta || exit 1

/usr/bin/srf2fasta $srcdir/data/both.srf > $outdir/slx.fasta
cmp $outdir/slx.fasta $srcdir/data/slx.fasta || exit 1
/usr/bin/srf2fasta -C $srcdir/data/both.srf > $outdir/slx.fasta
cmp $outdir/slx.fasta $srcdir/data/slx-C.fasta || exit 1
