#!/bin/sh
/usr/bin/srf2fastq $srcdir/data/proc.srf > $outdir/slx.fastq
cmp $outdir/slx.fastq $srcdir/data/slx.fastq || exit 1
/usr/bin/srf2fastq -C $srcdir/data/proc.srf > $outdir/slx.fastq
cmp $outdir/slx.fastq $srcdir/data/slx-C.fastq || exit 1

/usr/bin/srf2fastq $srcdir/data/raw.srf > $outdir/slx.fastq
cmp $outdir/slx.fastq $srcdir/data/slx.fastq || exit 1
/usr/bin/srf2fastq -C $srcdir/data/raw.srf > $outdir/slx.fastq
cmp $outdir/slx.fastq $srcdir/data/slx-C.fastq || exit 1

/usr/bin/srf2fastq $srcdir/data/both.srf > $outdir/slx.fastq
cmp $outdir/slx.fastq $srcdir/data/slx.fastq || exit 1
/usr/bin/srf2fastq -C $srcdir/data/both.srf > $outdir/slx.fastq
cmp $outdir/slx.fastq $srcdir/data/slx-C.fastq || exit 1
