# Hierarchy For Package org.snpeff.fileIterator

Package Hierarchies:

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## Class Hierarchy

- java.lang.Object
  - org.snpeff.fileIterator.BinSeqFileIterator<T> (implements java.lang.Iterable<T>, java.util.Iterator<E>)
    - org.snpeff.fileIterator.DnaSeqFileIterator
    - org.snpeff.fileIterator.DnaSeqIdFileIterator
    - org.snpeff.fileIterator.DnaSeqPeFileIterator
  - org.snpeff.fileIterator.BlastResultEntry (implements java.lang.Comparable<T>)
  - org.snpeff.fileIterator.FastqFileIterator (implements java.lang.Iterable<T>, java.util.Iterator<E>)
  - org.snpeff.fileIterator.FileIterator<T> (implements java.lang.Iterable<T>, java.util.Iterator<E>)
    - org.snpeff.fileIterator.FastaFileIterator
    - org.snpeff.fileIterator.LineClassFileIterator<T>
      - org.snpeff.fileIterator.BlastResultFileIterator
      - org.snpeff.fileIterator.MatrixEntryFileIterator
    - org.snpeff.fileIterator.LineFileIterator
      - org.snpeff.fileIterator.LineSeqFileIterator
    - org.snpeff.fileIterator.MarkerFileIterator<M>
      - org.snpeff.fileIterator.GenericMarkerFileIterator
      - org.snpeff.fileIterator.Gff3FileIterator
      - org.snpeff.fileIterator.MotifFileIterator
      - org.snpeff.fileIterator.RegulationFileIterator
        - org.snpeff.fileIterator.RegulationBedFileIterator
        - org.snpeff.fileIterator.RegulationGffFileIterator
      - org.snpeff.fileIterator.VariantFileIterator
        - org.snpeff.fileIterator.BedFileIterator
        - org.snpeff.fileIterator.BigBedFileIterator
        - org.snpeff.fileIterator.VariantTxtFileIterator
      - org.snpeff.fileIterator.VcfFileIterator (implements org.snpeff.fileIterator.parser.Parser<T>)
      - org.snpeff.fileIterator.VcfHapMapFileIterator
    - org.snpeff.fileIterator.SamFileIterator
  - org.snpeff.fileIterator.GuessTableTypes
  - org.snpeff.fileIterator.MatrixEntry
  - java.io.Reader (implements java.io.Closeable, java.lang.Readable)
    - java.io.BufferedReader
      - org.snpeff.fileIterator.SeekableBufferedReader
    - org.snpeff.fileIterator.NullReader
  - org.snpeff.fileIterator.TableFile (implements java.io.Serializable)