### - _ -

- _RD_ATOM_H : Atom.h

### - a -

- ASSERT_INVARIANT : Invariant.h

### - b -

- BOOST_ALLOW_DEPRECATED_HEADERS : utils.h
- BOOST_LOG : RDLog.h

### - c -

- CHECK_INVARIANT : Invariant.h
- CLEANUP : BFGSOpt.h

### - d -

- DUP_SUBSTRUCT_CACHE : DebugTrace.h

### - f -

- FAST_INCREMENTAL_MATCH : DebugTrace.h
- FAST_SUBSTRUCT_CACHE : DebugTrace.h

### - i -

- INVARIANT_EXCEPTION_METHOD : Invariant.h

### - m -

- M_PI : MMFF/Params.h , point.h , UFF/Params.h

### - n -

- NEXT_METHOD : iterator_next.h
- NPY_NO_DEPRECATED_API : import_array.h

### - p -

- POSTCONDITION : Invariant.h
- PRECONDITION : Invariant.h

### - r -

- RANGE_CHECK : Invariant.h
- RD_STRUCTCHECKER_H_Oct2016 : StructChecker.h
- rdcast : Invariant.h
- RDK_BUILD_COORDGEN_SUPPORT : RDConfig.h
- RDK_BUILD_SLN_SUPPORT : RDConfig.h
- RDK_BUILD_THREADSAFE_SSS : RDConfig.h
- RDK_TEST_MULTITHREADED : RDConfig.h
- RDK_THREADSAFE_SSS : RDConfig.h
- RDK_USE_BOOST_IOSTREAMS : RDConfig.h
- RDK_USE_BOOST_SERIALIZATION : RDConfig.h
- RDK_USE_STRICT_ROTOR_DEFINITION : RDConfig.h
- RDKIT_ALIGNMENT_EXPORT : export.h
- RDKIT_AVALON_CLIB_EXPORT : export.h
- RDKIT_AVALONLIB_EXPORT : export.h
- RDKIT_CATALOGS_EXPORT : export.h
- RDKIT_CHEMICALFEATURES_EXPORT : export.h
- RDKIT_CHEMREACTIONS_EXPORT : export.h
- RDKIT_CHEMTRANSFORMS_EXPORT : export.h
- RDKIT_CONFORMERPARSER_EXPORT : export.h
- RDKIT_COORDGEN_EXPORT : export.h
- RDKIT_DATASTRUCTS_EXPORT : export.h
- RDKIT_DEPICTOR_EXPORT : export.h
- RDKIT_DESCRIPTORS_EXPORT : export.h
- RDKIT_DISTGEOMETRY_EXPORT : export.h
- RDKIT_DISTGEOMHELPERS_EXPORT : export.h
- RDKIT_EHTLIB_EXPORT : export.h
- RDKIT_EIGENSOLVERS_EXPORT : export.h
- RDKIT_FILEPARSERS_EXPORT : export.h
- RDKIT_FILTERCATALOG_EXPORT : export.h
- RDKIT_FINGERPRINTS_EXPORT : export.h
- RDKIT_FMCS_EXPORT : export.h
- RDKIT_FORCEFIELD_EXPORT : export.h
- RDKIT_FORCEFIELDHELPERS_EXPORT : export.h
- RDKIT_FRAGCATALOG_EXPORT : export.h
- RDKIT_FREESASA_CLIB_EXPORT : export.h
- RDKIT_FREESASALIB_EXPORT : export.h
- RDKIT_GRAPHMOL_EXPORT : export.h
- RDKIT_HC_EXPORT : export.h
- RDKIT_INCHI_EXPORT : export.h
- RDKIT_INFOTHEORY_EXPORT : export.h
- RDKIT_MAEPARSER_EXPORT : export.h
- RDKIT_MMPA_EXPORT : export.h
- RDKIT_MOLALIGN_EXPORT : export.h
- RDKIT_MOLCATALOG_EXPORT : export.h
- RDKIT_MOLCHEMICALFEATURES_EXPORT : export.h
- RDKIT_MOLDRAW2D_EXPORT : export.h
- RDKIT_MOLHASH_EXPORT : export.h
- RDKIT_MOLINTERCHANGE_EXPORT : export.h
- RDKIT_MOLSTANDARDIZE_EXPORT : export.h
- RDKIT_MOLTRANSFORMS_EXPORT : export.h
- RDKIT_OPTIMIZER_EXPORT : export.h
- RDKIT_PARTIALCHARGES_EXPORT : export.h
- RDKIT_RDBOOST_EXPORT : export.h
- RDKIT_RDGENERAL_EXPORT : export.h
- RDKIT_RDGEOMETRYLIB_EXPORT : export.h
- RDKIT_RDINCHILIB_EXPORT : export.h
- RDKIT_RDSTREAMS_EXPORT : export.h
- RDKIT_REDUCEDGRAPHS_EXPORT : export.h
- RDKIT_RGROUPDECOMPOSITION_EXPORT : export.h
- RDKIT_RINGDECOMPOSERLIB_EXPORT : export.h
- RDKIT_SHAPEHELPERS_EXPORT : export.h
- RDKIT_SIMDIVPICKERS_EXPORT : export.h
- RDKIT_SLNPARSE_EXPORT : export.h
- RDKIT_SMILESPARSE_EXPORT : export.h
- RDKIT_STRUCTCHECKER_EXPORT : export.h
- RDKIT_SUBGRAPHS_EXPORT : export.h
- RDKIT_SUBSTRUCTLIBRARY_EXPORT : export.h
- RDKIT_SUBSTRUCTMATCH_EXPORT : export.h
- RDKIT_TRAJECTORY_EXPORT : export.h
- RDKIT_URFLIB_EXPORT : export.h
- RDKIT_VERSION : versions.h
- RDKIT_VERSION_CHECK : versions.h
- RDUNUSED_PARAM : Invariant.h
- RDVALUE_HASBOOL : RDValue-taggedunion.h , RDValue-doublemagic.h
- REGISTER_DESCRIPTOR : RegisterDescriptor.h

### - s -

- SEED_GROW_DEEP : DebugTrace.h

### - t -

- TEST_ASSERT : Invariant.h

### - u -

- UNDER_CONSTRUCTION : Invariant.h
- URANGE_CHECK : Invariant.h

### - v -

- VERBOSE_STATISTICS_ON : DebugTrace.h

### - x -

- xsect : Conrec.h

### - y -

- ysect : Conrec.h