### - a -

- ActivatePartitions() : RDKit::Canon
- addAngles() : RDKit::MMFF::Tools , RDKit::UFF::Tools
- addAtomChargeFlags() : RDKit::UFF::Tools
- addAtomToMol() : RDKit::SLNParse
- addBonds() : RDKit::MMFF::Tools , RDKit::UFF::Tools
- addBranchToMol() : RDKit::SLNParse
- addEle() : RDKit::MMFF::Tools
- addFragToMol() : RDKit::SLNParse
- AddFragToMol() : SmilesParseOps
- addHs() : RDKit::MolOps
- addInversions() : RDKit::UFF::Tools
- addNonbonded() : RDKit::UFF::Tools
- addOop() : RDKit::MMFF::Tools
- addRecursiveQueries() : RDKit
- addRecursiveQueriesToReaction() : RDKit
- addStretchBend() : RDKit::MMFF::Tools
- addTorsions() : RDKit::MMFF::Tools , RDKit::UFF::Tools
- addVdW() : RDKit::MMFF::Tools
- adjustAtomChiralities() : RDKit::SLNParse
- AdjustAtomChiralityFlags() : SmilesParseOps
- adjustHs() : RDKit::MolOps
- alignMol() : RDKit::MolAlign
- alignMolConformers() : RDKit::MolAlign
- AlignPoints() : RDNumeric::Alignments
- appendPackedIntToStream() : RDKit
- arcPoints() : RDKit::MolDraw2D_detail
- areAtomsInSameAromaticRing() : RDKit::MMFF
- areAtomsInSameRingOfSize() : RDKit::MMFF
- assignChiralTypesFrom3D() : RDKit::MolOps
- assignRadicals() : RDKit::MolOps
- assignStereochemistry() : RDKit::MolOps
- atomCompat() : RDKit
- atomHasConjugatedBond() : RDKit::MolOps