Here is a list of all class members with links to the classes they belong to:

### - g -

- G_i : ForceFields::MMFF::MMFFVdW
- GasteigerParams() : RDKit::GasteigerParams
- gather() : ForceFields::ForceField
- generateNext() : RDKit::FMCS::Composition2N
- get() : RDKit::MolAlign::MolHistogram
- getAbundanceForIsotope() : RDKit::PeriodicTable
- getActiveAtom() : RDKit::RWMol
- getActiveConformer() : RDKit::MolChemicalFeature
- getAgents() : RDKit::ChemicalReaction
- getAllAtomsWithBookmark() : RDKit::ROMol
- getAllBondsWithBookmark() : RDKit::ROMol
- getAltLoc() : RDKit::AtomPDBResidueInfo
- getAtIdx() : RDKit::RecursiveStructureQuery
- getAtomBonds() : RDKit::ROMol
- getAtomBookmarks() : RDKit::ROMol
- getAtomCoords() : RDKit::MolDraw2D
- getAtomDegree() : RDKit::ROMol
- getAtomicNum() : RDKit::Atom
- getAtomicNumber() : RDKit::PeriodicTable
- getAtomicWeight() : RDKit::PeriodicTable
- getAtomNeighbors() : RDKit::ROMol
- getAtomPos() : RDKit::Conformer
- getAtoms() : RDKit::MolChemicalFeature
- getAtomWithBookmark() : RDKit::ROMol
- getAtomWithIdx() : RDKit::ROMol
- getBeginAtom() : RDKit::Bond
- getBeginAtomIdx() : RDKit::Bond
- getBit() : BitVect , ExplicitBitVect , SparseBitVect
- getBitId() : RDCatalog::CatalogEntry
- getBitSet() : RDKit::FMCS::Composition2N , SparseBitVect
- getBondBetweenAtoms() : RDKit::ROMol
- getBondBookmarks() : RDKit::ROMol
- getBondDir() : RDKit::Bond
- getBondType() : RDKit::Bond
- getBondTypeAsDouble() : RDKit::Bond
- getBondWithBookmark() : RDKit::ROMol
- getBondWithIdx() : RDKit::ROMol
- getBoxNx() : RDDepict::EmbeddedFrag
- getBoxNy() : RDDepict::EmbeddedFrag
- getBoxPx() : RDDepict::EmbeddedFrag
- getBoxPy() : RDDepict::EmbeddedFrag
- getCatalogParams() : RDCatalog::Catalog< entryType, paramType >
- getChainId() : RDKit::AtomPDBResidueInfo
- getChiralTag() : RDKit::Atom
- getCol() : RDNumeric::Matrix< TYPE > , RDNumeric::SymmMatrix< TYPE >
- getConformer() : RDKit::ROMol
- getCorrBitList() : RDInfoTheory::BitCorrMatGenerator
- getCorrMat() : RDInfoTheory::BitCorrMatGenerator
- getCost() : RDKit::MolAlign::LAP
- getData() : RDKit::DiscreteValueVect , RDNumeric::Matrix< TYPE > , RDNumeric::SymmMatrix< TYPE > , RDNumeric::Vector< TYPE >
- getDataFunc : Queries::Query< MatchFuncArgType, DataFuncArgType, needsConversion >
- getDataSize() : RDNumeric::Matrix< TYPE > , RDNumeric::SymmMatrix< TYPE >
- getDefaultValence() : RDKit::PeriodicTable
- getDegree() : RDKit::Atom
- getDescription() : Queries::Query< MatchFuncArgType, DataFuncArgType, needsConversion > , RDCatalog::CatalogEntry , RDKit::FragCatalogEntry , RDKit::MolCatalogEntry
- getDirs() : RDFeatures::ExplicitFeature< FAMILYMARKER, TYPEMARKER, LOCTYPE > , RDFeatures::ImplicitFeature< FAMILYMARKER, TYPEMARKER, LOCTYPE >
- getDiscrims() : RDKit::FragCatalogEntry
- getDist() : RDKit::DiscreteDistMat
- getDownEntryList() : RDCatalog::HierarchCatalog< entryType, paramType, orderType >
- getDrawCoords() : RDKit::MolDraw2D
- getDrawingText() : RDKit::MolDraw2DCairo , RDKit::MolDraw2DSVG
- getEdges() : RDKit::ROMol
- getElementSymbol() : RDKit::PeriodicTable
- GetEmbeddedAtom() : RDDepict::EmbeddedFrag
- GetEmbeddedAtoms() : RDDepict::EmbeddedFrag
- getEndAtom() : RDKit::Bond
- getEndAtomIdx() : RDKit::Bond
- getEndsOpen() : Queries::RangeQuery< MatchFuncArgType, DataFuncArgType, needsConversion >
- getEnergy() : DistGeom::ChiralViolationContrib , DistGeom::DistViolationContrib , DistGeom::FourthDimContrib , ForceFields::ForceFieldContrib , ForceFields::MMFF::AngleBendContrib , ForceFields::MMFF::AngleConstraintContrib , ForceFields::MMFF::BondStretchContrib , ForceFields::MMFF::DistanceConstraintContrib , ForceFields::MMFF::EleContrib , ForceFields::MMFF::OopBendContrib , ForceFields::MMFF::PositionConstraintContrib , ForceFields::MMFF::StretchBendContrib , ForceFields::MMFF::TorsionAngleContrib , ForceFields::MMFF::TorsionConstraintContrib , ForceFields::MMFF::VdWContrib , ForceFields::UFF::AngleBendContrib , ForceFields::UFF::AngleConstraintContrib , ForceFields::UFF::BondStretchContrib , ForceFields::UFF::DistanceConstraintContrib , ForceFields::UFF::InversionContrib , ForceFields::UFF::PositionConstraintContrib , ForceFields::UFF::TorsionAngleContrib , ForceFields::UFF::TorsionConstraintContrib , ForceFields::UFF::vdWContrib
- getEntriesOfOrder() : RDCatalog::HierarchCatalog< entryType, paramType, orderType >
- getEntryWithBitId() : RDCatalog::HierarchCatalog< entryType, paramType, orderType >
- getEntryWithIdx() : RDCatalog::Catalog< entryType, paramType > , RDCatalog::HierarchCatalog< entryType, paramType, orderType > , RDCatalog::LinearCatalog< entryType, orderType >
- getExplicitValence() : RDKit::Atom
- getExpression() : Invar::Invariant
- getFactory() : RDKit::MolChemicalFeature
- getFamily() : ChemicalFeatures::ChemicalFeature , ChemicalFeatures::FreeChemicalFeature , RDFeatures::ExplicitFeature< FAMILYMARKER, TYPEMARKER, LOCTYPE > , RDFeatures::ImplicitFeature< FAMILYMARKER, TYPEMARKER, LOCTYPE > , RDKit::MolChemicalFeature , RDKit::MolChemicalFeatureDef
- getFeatDef() : RDKit::MolChemicalFeature
- getFeaturesForMol() : RDKit::MolChemicalFeatureFactory
- getFile() : Invar::Invariant
- getForceV3000() : RDKit::SDWriter
- getFormalCharge() : RDKit::Atom
- getFPForMol() : RDKit::FragFPGenerator
- getFPLength() : RDCatalog::Catalog< entryType, paramType >
- getFullDescription() : Queries::EqualityQuery< MatchFuncArgType, DataFuncArgType, needsConversion > , Queries::GreaterEqualQuery< MatchFuncArgType, DataFuncArgType, needsConversion > , Queries::GreaterQuery< MatchFuncArgType, DataFuncArgType, needsConversion > , Queries::LessEqualQuery< MatchFuncArgType, DataFuncArgType, needsConversion > , Queries::LessQuery< MatchFuncArgType, DataFuncArgType, needsConversion > , Queries::Query< MatchFuncArgType, DataFuncArgType, needsConversion > , Queries::RangeQuery< MatchFuncArgType, DataFuncArgType, needsConversion > , Queries::SetQuery< MatchFuncArgType, DataFuncArgType, needsConversion >
- getFuncGroup() : RDKit::FragCatParams
- getFuncGroupMap() : RDKit::FragCatalogEntry
- getFuncGroups() : RDKit::FragCatParams
- getGrad() : DistGeom::ChiralViolationContrib , DistGeom::DistViolationContrib , DistGeom::FourthDimContrib , ForceFields::ForceFieldContrib , ForceFields::MMFF::AngleBendContrib , ForceFields::MMFF::AngleConstraintContrib , ForceFields::MMFF::BondStretchContrib , ForceFields::MMFF::DistanceConstraintContrib , ForceFields::MMFF::EleContrib , ForceFields::MMFF::OopBendContrib , ForceFields::MMFF::PositionConstraintContrib , ForceFields::MMFF::StretchBendContrib , ForceFields::MMFF::TorsionAngleContrib , ForceFields::MMFF::TorsionConstraintContrib , ForceFields::MMFF::VdWContrib , ForceFields::UFF::AngleBendContrib , ForceFields::UFF::AngleConstraintContrib , ForceFields::UFF::BondStretchContrib , ForceFields::UFF::DistanceConstraintContrib , ForceFields::UFF::InversionContrib , ForceFields::UFF::PositionConstraintContrib , ForceFields::UFF::TorsionAngleContrib , ForceFields::UFF::TorsionConstraintContrib , ForceFields::UFF::vdWContrib
- getGridIndex() : RDGeom::UniformGrid3D
- getGridIndices() : RDGeom::UniformGrid3D
- getGridPointIndex() : RDGeom::Grid3D , RDGeom::UniformGrid3D
- getGridPointLoc() : RDGeom::Grid3D , RDGeom::UniformGrid3D
- getHybridization() : RDKit::Atom
- getId() : ChemicalFeatures::ChemicalFeature , ChemicalFeatures::FreeChemicalFeature , RDKit::Conformer , RDKit::MolChemicalFeature
- getIdOfEntryWithBitId() : RDCatalog::HierarchCatalog< entryType, paramType, orderType >
- getIdx() : RDKit::Atom , RDKit::Bond
- getImplicitPropertiesFlag() : RDKit::ChemicalReaction
- getImplicitValence() : RDKit::Atom
- getInsertionCode() : RDKit::AtomPDBResidueInfo
- getIsAromatic() : RDKit::Atom , RDKit::Bond
- getIsConjugated() : RDKit::Bond
- getIsHeteroAtom() : RDKit::AtomPDBResidueInfo
- getIsotope() : RDKit::Atom
- getItemText() : RDKit::SDMolSupplier , RDKit::SmilesMolSupplier , RDKit::TDTMolSupplier
- getKekulize() : RDKit::SDWriter
- getLastAtom() : RDKit::RWMol
- getLength() : RDKit::DiscreteValueVect , RDKit::SparseIntVect< IndexType >
- getLine() : Invar::Invariant
- getLoc() : RDFeatures::ExplicitFeature< FAMILYMARKER, TYPEMARKER, LOCTYPE > , RDFeatures::ImplicitFeature< FAMILYMARKER, TYPEMARKER, LOCTYPE >
- getLower() : Queries::RangeQuery< MatchFuncArgType, DataFuncArgType, needsConversion >
- getLowerBound() : DistGeom::BoundsMatrix
- getLowerFragLength() : RDKit::FragCatParams
- getLowerVolumeBound() : DistGeom::ChiralSet
- getMass() : RDKit::Atom
- getMassForIsotope() : RDKit::PeriodicTable
- getMatchFunc : Queries::Query< MatchFuncArgType, DataFuncArgType, needsConversion >
- getMaxNumberAtoms() : RDKit::FMCS::MaximumCommonSubgraph
- getMaxNumberBonds() : RDKit::FMCS::MaximumCommonSubgraph
- getMessage() : Invar::Invariant
- getMMFFAngle() : ForceFields::MMFF::MMFFAngleCollection
- getMMFFAngleBendParams() : RDKit::MMFF::MMFFMolProperties
- getMMFFAngleTerm() : RDKit::MMFF::MMFFMolProperties
- getMMFFAngleType() : RDKit::MMFF::MMFFMolProperties
- getMMFFArom() : ForceFields::MMFF::MMFFAromCollection
- getMMFFAtomType() : RDKit::MMFF::MMFFMolProperties
- getMMFFBndk() : ForceFields::MMFF::MMFFBndkCollection
- getMMFFBond() : ForceFields::MMFF::MMFFBondCollection
- getMMFFBondStretchEmpiricalRuleParams() : RDKit::MMFF::MMFFMolProperties
- getMMFFBondStretchParams() : RDKit::MMFF::MMFFMolProperties
- getMMFFBondTerm() : RDKit::MMFF::MMFFMolProperties
- getMMFFBondType() : RDKit::MMFF::MMFFMolProperties
- getMMFFChg() : ForceFields::MMFF::MMFFChgCollection
- getMMFFChgParams() : ForceFields::MMFF::MMFFChgCollection
- getMMFFCovRadPauEle() : ForceFields::MMFF::MMFFCovRadPauEleCollection
- getMMFFDef() : ForceFields::MMFF::MMFFDefCollection
- getMMFFDfsb() : ForceFields::MMFF::MMFFDfsbCollection
- getMMFFDfsbParams() : ForceFields::MMFF::MMFFDfsbCollection
- getMMFFDielectricConstant() : RDKit::MMFF::MMFFMolProperties
- getMMFFDielectricModel() : RDKit::MMFF::MMFFMolProperties
- getMMFFEleTerm() : RDKit::MMFF::MMFFMolProperties
- getMMFFFormalCharge() : RDKit::MMFF::MMFFMolProperties
- getMMFFHerschbachLaurie() : ForceFields::MMFF::MMFFHerschbachLaurieCollection
- getMMFFOop() : ForceFields::MMFF::MMFFOopCollection
- getMMFFOopBendParams() : RDKit::MMFF::MMFFMolProperties
- getMMFFOopTerm() : RDKit::MMFF::MMFFMolProperties
- getMMFFOStream() : RDKit::MMFF::MMFFMolProperties
- getMMFFPartialCharge() : RDKit::MMFF::MMFFMolProperties
- getMMFFPBCI() : ForceFields::MMFF::MMFFPBCICollection
- getMMFFProp() : ForceFields::MMFF::MMFFPropCollection
- getMMFFStbn() : ForceFields::MMFF::MMFFStbnCollection
- getMMFFStbnParams() : ForceFields::MMFF::MMFFStbnCollection
- getMMFFStretchBendParams() : RDKit::MMFF::MMFFMolProperties
- getMMFFStretchBendTerm() : RDKit::MMFF::MMFFMolProperties
- getMMFFTor() : ForceFields::MMFF::MMFFTorCollection
- getMMFFTorParams() : ForceFields::MMFF::MMFFTorCollection
- getMMFFTorsionEmpiricalRuleParams() : RDKit::MMFF::MMFFMolProperties
- getMMFFTorsionParams() : RDKit::MMFF::MMFFMolProperties
- getMMFFTorsionTerm() : RDKit::MMFF::MMFFMolProperties
- getMMFFTorsionType() : RDKit::MMFF::MMFFMolProperties
- getMMFFVariant() : RDKit::MMFF::MMFFMolProperties
- getMMFFVdW() : ForceFields::MMFF::MMFFVdWCollection
- getMMFFVdWParams() : RDKit::MMFF::MMFFMolProperties
- getMMFFVdWTerm() : RDKit::MMFF::MMFFMolProperties
- getMMFFVerbosity() : RDKit::MMFF::MMFFMolProperties
- getMol() : RDDepict::EmbeddedFrag , RDKit::MolCatalogEntry , RDKit::MolChemicalFeature
- getMonomerInfo() : RDKit::Atom
- getMonomerType() : RDKit::AtomMonomerInfo
- getMostCommonIsotope() : RDKit::PeriodicTable
- getMostCommonIsotopeMass() : RDKit::PeriodicTable
- getName() : RDKit::AtomMonomerInfo
- getNegation() : Queries::Query< MatchFuncArgType, DataFuncArgType, needsConversion >
- getNoImplicit() : RDKit::Atom
- getNonzeroElements() : RDKit::SparseIntVect< IndexType >
- getNouterElecs() : RDKit::PeriodicTable
- getNumAgentTemplates() : RDKit::ChemicalReaction
- getNumAtoms() : RDKit::Conformer , RDKit::FMCS::DuplicatedSeedCache::TKey , RDKit::FMCS::Seed , RDKit::MolChemicalFeature , RDKit::ROMol
- getNumBits() : BitVect , ExplicitBitVect , SparseBitVect
- getNumBitsPerVal() : RDKit::DiscreteValueVect
- getNumBonds() : RDKit::FMCS::DuplicatedSeedCache::TKey , RDKit::FMCS::Seed , RDKit::ROMol
- getNumClasses() : RDInfoTheory::InfoBitRanker
- getNumConformers() : RDKit::ROMol
- getNumDigits() : RDKit::TDTWriter
- getNumEntries() : RDCatalog::Catalog< entryType, paramType > , RDCatalog::HierarchCatalog< entryType, paramType, orderType >
- getNumExamples() : RDInfoTheory::BitCorrMatGenerator
- getNumExplicitHs() : RDKit::Atom
- getNumFeatureDefs() : RDKit::MolChemicalFeatureFactory
- getNumFuncGroups() : RDKit::FragCatParams
- getNumHeavyAtoms() : RDKit::ROMol
- getNumImplicitHs() : RDKit::Atom
- getNumInstances() : RDInfoTheory::InfoBitRanker
- getNumInts() : RDKit::DiscreteValueVect
- getNumOffBits() : BitVect , ExplicitBitVect , SparseBitVect
- getNumOnBits() : BitVect , ExplicitBitVect , SparseBitVect
- getNumProductTemplates() : RDKit::ChemicalReaction
- getNumRadicalElectrons() : RDKit::Atom
- getNumReactantTemplates() : RDKit::ChemicalReaction
- getNumWeights() : RDKit::MolChemicalFeatureDef
- getNumX() : RDGeom::UniformGrid3D
- getNumY() : RDGeom::UniformGrid3D
- getNumZ() : RDGeom::UniformGrid3D
- getOccupancy() : RDKit::AtomPDBResidueInfo
- getOccupancyVect() : RDGeom::Grid3D , RDGeom::UniformGrid3D
- getOffset() : RDGeom::UniformGrid3D
- getOnBits() : BitVect , ExplicitBitVect , SparseBitVect
- getOrder() : RDKit::FragCatalogEntry , RDKit::MolCatalogEntry
- getOtherAtom() : RDKit::Bond
- getOtherAtomIdx() : RDKit::Bond
- getOwningMol() : RDKit::Atom , RDKit::Bond , RDKit::Conformer
- getParams() : ForceFields::UFF::ParamCollection , RDKit::Descriptors::CrippenParamCollection , RDKit::GasteigerParams
- getPattern() : RDKit::MolChemicalFeatureDef
- getPerpendicular() : RDGeom::Point3D
- getPerturbationOrder() : RDKit::Atom
- getPos() : ChemicalFeatures::ChemicalFeature , ChemicalFeatures::FreeChemicalFeature , RDKit::MolChemicalFeature
- getPositions() : RDKit::Conformer
- getPrbIdx() : RDKit::MolAlign::O3AConstraint
- getProducts() : RDKit::ChemicalReaction
- getProp() : RDKit::Atom , RDKit::Bond , RDKit::FragCatalogEntry , RDKit::MolCatalogEntry , RDKit::ROMol
- getPropIfPresent() : RDKit::Atom , RDKit::Bond , RDKit::ROMol
- getPropList() : RDKit::Atom , RDKit::Bond , RDKit::ROMol
- getQuery() : RDKit::Atom , RDKit::Bond , RDKit::QueryAtom , RDKit::QueryBond
- getQueryBondRings() : RDKit::FMCS::RingMatchTableSet
- getQueryMol() : RDKit::RecursiveStructureQuery
- getQueryMolecule() : RDKit::FMCS::MaximumCommonSubgraph
- getRb0() : RDKit::PeriodicTable
- getRcovalent() : RDKit::PeriodicTable
- getReactants() : RDKit::ChemicalReaction
- getRefIdx() : RDKit::MolAlign::O3AConstraint
- getResidueName() : RDKit::AtomPDBResidueInfo
- getResidueNumber() : RDKit::AtomPDBResidueInfo
- getRingInfo() : RDKit::ROMol
- getRow() : RDNumeric::Matrix< TYPE > , RDNumeric::SymmMatrix< TYPE >
- getRowSol() : RDKit::MolAlign::LAP
- getRvdw() : RDKit::PeriodicTable
- getSecondaryStructure() : RDKit::AtomPDBResidueInfo
- getSegmentNumber() : RDKit::AtomPDBResidueInfo
- getSerialNumber() : RDKit::AtomPDBResidueInfo , RDKit::RecursiveStructureQuery
- getSize() : RDGeom::Grid3D , RDGeom::UniformGrid3D
- getSmarts() : RDKit::FragCatalogEntry , RDKit::MolChemicalFeatureDef
- getSpacing() : RDGeom::UniformGrid3D
- getStereo() : RDKit::Bond
- getStereoAtoms() : RDKit::Bond
- getStringSize() : RDKit::MolDraw2D , RDKit::MolDraw2DCairo , RDKit::MolDraw2DQt , RDKit::MolDraw2DSVG , RDKit::MolDraw2Dwx
- getSymbol() : RDKit::Atom
- getTable() : RDKit::PeriodicTable
- getTargetBondRings() : RDKit::FMCS::RingMatchTableSet
- getTempFactor() : RDKit::AtomPDBResidueInfo
- getTol() : Queries::EqualityQuery< MatchFuncArgType, DataFuncArgType, needsConversion > , Queries::RangeQuery< MatchFuncArgType, DataFuncArgType, needsConversion >
- getTolerance() : RDKit::FragCatParams
- getTopN() : RDInfoTheory::InfoBitRanker
- getTopology() : RDKit::ROMol
- getTotalDegree() : RDKit::Atom
- getTotalNumHs() : RDKit::Atom
- getTotalVal() : RDKit::DiscreteValueVect , RDKit::SparseIntVect< IndexType >
- getTotalValence() : RDKit::Atom
- getType() : ChemicalFeatures::ChemicalFeature , ChemicalFeatures::FreeChemicalFeature , RDFeatures::ExplicitFeature< FAMILYMARKER, TYPEMARKER, LOCTYPE > , RDFeatures::ImplicitFeature< FAMILYMARKER, TYPEMARKER, LOCTYPE > , RDKit::MolChemicalFeature , RDKit::MolChemicalFeatureDef
- getTypeStr() : RDCatalog::CatalogParams
- getUpper() : Queries::RangeQuery< MatchFuncArgType, DataFuncArgType, needsConversion >
- getUpperBound() : DistGeom::BoundsMatrix
- getUpperFragLength() : RDKit::FragCatParams
- getUpperVolumeBound() : DistGeom::ChiralSet
- getVal() : Queries::EqualityQuery< MatchFuncArgType, DataFuncArgType, needsConversion > , RDGeom::Grid3D , RDGeom::UniformGrid3D , RDKit::Dict , RDKit::DiscreteValueVect , RDKit::SparseIntVect< IndexType > , RDNumeric::Matrix< TYPE > , RDNumeric::SymmMatrix< TYPE > , RDNumeric::Vector< TYPE >
- getValenceContrib() : RDKit::Bond
- getValenceList() : RDKit::PeriodicTable
- getValIfPresent() : RDKit::Dict
- getValueType() : RDKit::DiscreteValueVect
- getVertices() : RDKit::ROMol
- getWeight() : RDKit::MolAlign::O3AConstraint
- getWrite2D() : RDKit::TDTWriter
- getWriteNames() : RDKit::TDTWriter
- getXSize() : RDKit::FMCS::TArray2D< T >
- getYSize() : RDKit::FMCS::TArray2D< T >
- GMP_Hardness : ForceFields::UFF::AtomicParams
- GMP_Radius : ForceFields::UFF::AtomicParams
- GMP_Xi : ForceFields::UFF::AtomicParams
- GOWER : RDPickers::HierarchicalClusterPicker
- greater() : RDKit::Canon::bondholder
- GreaterEqualQuery() : Queries::GreaterEqualQuery< MatchFuncArgType, DataFuncArgType, needsConversion >
- GreaterQuery() : Queries::GreaterQuery< MatchFuncArgType, DataFuncArgType, needsConversion >
- GridException() : RDGeom::GridException
- grow() : RDKit::FMCS::Seed
- GrowingStage : RDKit::FMCS::Seed