NanoStringQCPro-package	NanoStringQCPro
.RccSet	RccSet-class
addCodesetAnnotation	addCodesetAnnotation
addCodesetAnnotation,RccSet-method	addCodesetAnnotation
addQCFlags	addQCFlags
addQCFlags,RccSet-method	addQCFlags
allSumPlot	allSumPlot
allSumPlot,RccSet-method	allSumPlot
assessHousekeeping	assessHousekeeping
assessHousekeeping,RccSet-method	assessHousekeeping
bdPlot	bdPlot
bdPlot,RccSet-method	bdPlot
buildCodesetAnnotation	buildCodesetAnnotation
checkRccSet	checkRccSet
checkRccSet,RccSet-method	checkRccSet
colByCovar	colByCovar
colByFun	colByFun
contentNorm	contentNorm
contentNorm,RccSet-method	contentNorm
copyRccSet	copyRccSet
copyRccSet,RccSet-method	copyRccSet
countsInBlankSamples_verticalPlot	countsInBlankSamples_verticalPlot
ctrlsOverviewPlot	ctrlsOverviewPlot
ctrlsOverviewPlot,RccSet-method	ctrlsOverviewPlot
ctrlsZprimePlot	ctrlsZprimePlot
ctrlsZprimePlot,RccSet-method	ctrlsZprimePlot
cutoffByMMAD	cutoffByMMAD
cutoffByVar	cutoffByVar
dCoVar	dCoVar
densityPlot	densityPlot
example_rccSet	example_rccSet
flagSamplesCount	flagSamplesCount
flagSamplesCount,RccSet-method	flagSamplesCount
flagSamplesCtrl	flagSamplesCtrl
flagSamplesCtrl,RccSet-method	flagSamplesCtrl
flagSamplesTech	flagSamplesTech
flagSamplesTech,RccSet-method	flagSamplesTech
fovPlot	fovPlot
fovPlot,RccSet-method	fovPlot
geneClustering	geneClustering
getBackground	getBackground
getBackground,RccSet-method	getBackground
getBlankLabel	getBlankLabel
getBlankLabel,RccSet-method	getBlankLabel
getSpikeInInput	getSpikeInInput
iqrPlot	iqrPlot
iqrPlot,RccSet-method	iqrPlot
lodAssess	lodAssess
lodAssess,RccSet-method	lodAssess
lodPlot	lodPlot
lodPlot,RccSet-method	lodPlot
makeQCReport	makeQCReport
makeQCReport,RccSet-method	makeQCReport
myCols	myCols
NanoStringQCPro	NanoStringQCPro
negCtrlsByLane	negCtrlsByLane
negCtrlsByLane,RccSet-method	negCtrlsByLane
negCtrlsByLane_verticalPlot	negCtrlsByLane_verticalPlot
negCtrlsPairs	negCtrlsPairs
negCtrlsPairs,RccSet-method	negCtrlsPairs
negCtrlsPlot	negCtrlsPlot
negCtrlsPlot,RccSet-method	negCtrlsPlot
newRccSet	newRccSet
nSolverBackground	nSolverBackground
nSolverBackground,RccSet-method	nSolverBackground
nSolverCsv.to.pdata_fdata_adata	nSolverCsv.to.pdata_fdata_adata
panelCor	panelCor
pcaPlot	pcaPlot
pdata_fdata_adata.to.rccSet	pdata_fdata_adata.to.rccSet
posCtrlNorm	posCtrlNorm
posCtrlNorm,RccSet-method	posCtrlNorm
posNormFactPlot	posNormFactPlot
posNormFactPlot,RccSet-method	posNormFactPlot
posR2Plot	posR2Plot
posR2Plot,RccSet-method	posR2Plot
posRatioPlot	posRatioPlot
posRatioPlot,RccSet-method	posRatioPlot
posSlopePlot	posSlopePlot
posSlopePlot,RccSet-method	posSlopePlot
posSumVsAllSumPlot	posSumVsAllSumPlot
posSumVsAllSumPlot,RccSet-method	posSumVsAllSumPlot
preprocRccSet	preprocRccSet
preprocRccSet,RccSet-method	preprocRccSet
presAbsCall	presAbsCall
presAbsCall,RccSet-method	presAbsCall
previewPNG	previewPNG
rccFiles.to.pdata_fdata_adata	rccFiles.to.pdata_fdata_adata
RccSet	RccSet
RccSet,environment-method	RccSet
RccSet,ExpressionSet-method	RccSet
RccSet,matrix-method	RccSet
RccSet,missing-method	RccSet
RccSet-class	RccSet-class
readCdrDesignData	readCdrDesignData
readRcc	readRcc
readRccBatch	readRccBatch
readRccCollectorToolExport	readRccCollectorToolExport
readRlf	readRlf
sampleClustering	sampleClustering
sampleClustering,RccSet-method	sampleClustering
scatterPair	scatterPair
subtractBackground	subtractBackground
subtractBackground,RccSet-method	subtractBackground
zfacFun	zfacFun
