##Dans cet exemple on cherche des modeles composes d'un seul bloc sur un
## alphabet degenere A,C,G,T,R,Y,N (voir fichier 'alphabet_deg').

FASTA file                      fasta
Output file                     1bloc_deg
Alphabet file                   alphabet_deg
Quorum                          90
Total min length                6
Total max length                8
Total substitutions             0
Boxes                           1

Composition in *                1
## Pas plus d'un joker par modele (* represente le joker).
## Etant donne qu'on a mis le joker dans l'alphabet (fichier 'alphabet_deg'),
## il est necessaire de limiter la composition des modeles en '*'.
## Sinon, beaucoup de modeles sans grand interet vont etre generes.

Size k-mer                      2
Shufflings                      10

