## Dans cet exemple on utilise les "Delta", c'est a dire que les modeles trouves
## doivent...

FASTA file              fasta
Output file             delta
Alphabet file           alphabet
Quorum                  70
Total min length        5
Total max length        6
Total substitutions     0
Boxes                   2

BOX 1
Min length              2
Max length              3
Substitutions           0
## ...non seulement avoir un saut de 2 a 8 nucleotides entre les 2 blocs...
Min spacer length       2
Max spacer length       8
## ...mais a l'interieur meme de cet intervalle on veut que les occurrences
## soient regroupees dans un intervalle [d-delta, d+delta] ou d appartient a
## l'intervalle 2-8. Autant de fichiers resultats seront generes qu'il
## y a de combinaisons possibles. Ici les intervalles de saut pour un modele
## sont donc: [2-4], [3-5], [4-6], [5-7], [6-8].
Delta                   1

BOX 2
Min length              3
Max length              3
Substitutions           0

## Si l'on veut evaluer les modeles de chaque fichier, on place ici
## les lignes d'evaluation habituelles (shuffling ou contre).
