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Here is a list of all documented class members with links to the class documentation for each member:

### - s -

- scale() : Camera
- scanDirectory() : PackageManager
- scene() : GLRenderer
- sceneModel() : GLWidget
- scfType() : GaussianSet
- schoenflies() : SpaceGroups
- scriptFilePath() : InputGenerator, InterfaceScript, PythonScript
- searchSystemPathForFile() : FileBrowseWidget
- searchSystemPathForFiles() : FileBrowseWidget
- SelectProgramFromTemplate : MoleQueueDialog
- sendRequest() : JsonRpcClient
- serialize() : LayerData
- ServerId : BatchJob
- serverId() : BatchJob
- serverName() : JsonRpcClient
- set() : Color3f, Constraint, PersistentAtom< Molecule_T >, PersistentBond< Molecule_T >
- setActiveCubeIndex() : Molecule
- setActiveGLWidget() : ActiveObjects
- setActiveLayer() : Layer
- setActiveMolecule() : ActiveObjects
- setActiveSetStep() : GaussianSet
- setActiveTool() : GLWidget
- setActiveWidget() : ExtensionPlugin, ToolPlugin, ActiveObjects
- setAdditionalInputFiles() : JobObject
- setAlign() : TextProperties
- setAlpha() : TextProperties
- setAnchor() : TextLabel2D, TextLabel3D
- setArc() : ArcStrip
- setArcSector() : ArcSector
- setAtomicNumber() : AtomTemplate< Molecule_T >, Molecule, RWMolecule
- setAtomicNumbers() : Molecule, RWMolecule
- setAtomLabel() : Molecule, RWMolecule
- setAtomLabels() : Molecule
- setAtomPosition2d() : Molecule
- setAtomPosition3d() : Molecule, RWMolecule
- setAtomPositions2d() : Molecule
- setAtomPositions3d() : Molecule, RWMolecule
- setAtomSelected() : Molecule, RWMolecule
- setAttributeArray() : ShaderProgram
- setAVector() : UnitCell
- setAxisColor() : ChartWidget
- setAxisDigits() : ChartWidget
- setAxisLimits() : ChartWidget
- setAxisLogScale() : ChartWidget
- setBackgroundColor() : ChartWidget, Scene
- setBasisSet() : Molecule
- setBatchMode() : InputGeneratorWidget, MoleQueueWidget
- setBlue() : TextProperties
- setBold() : TextProperties
- setBondLabel() : Molecule, RWMolecule
- setBondLabels() : Molecule
- setBondOrder() : Molecule, RWMolecule
- setBondOrders() : Molecule, RWMolecule
- setBondPair() : Molecule, RWMolecule
- setBondPairs() : Molecule, RWMolecule
- setBooleanOption() : JsonWidget
- setBVector() : UnitCell
- setCamera() : ExtensionPlugin
- setCellMatrix() : CrystalTools, UnitCell
- setCellParameters() : UnitCell
- setCellVolume() : RWMolecule
- setColor() : AtomTemplate< Molecule_T >, Molecule, Residue, ColorButton, RWMolecule, ArrowGeometry, DashedLineGeometry, LineStripGeometry, MeshGeometry, WideLineGeometry
- setColorRgb() : TextProperties
- setColorRgba() : TextProperties
- setColors() : Mesh, Molecule
- setConstraints() : Molecule
- setCount() : GaussianSet
- setCube() : Mesh, VolumeGeometry
- setCustomElementMap() : Molecule
- setCVector() : UnitCell
- setData() : Cube, Molecule
- setDataMap() : Molecule
- setDebug() : InputGenerator, InterfaceScript, PythonScript
- setDefaultPythonInterpreter() : PythonScript
- setDefaultTool() : GLWidget
- setDensityMatrix() : GaussianSet
- setDescription() : JobObject
- setDialogTitle() : ColorButton
- setDielectric() : ChargeModel
- setDirty() : Scene
- setDistanceUnit() : CoordinateBlockGenerator
- setElectronCount() : BasisSet
- setElectronType() : GaussianSetTools
- setElement() : ElementDetail, PeriodicTableView
- setEnabled() : PluginLayerManager, ScenePlugin
- setFileName() : BackgroundFileFormat
- setFilePathOption() : JsonWidget
- setFloatOption() : JsonWidget
- setFocus() : Camera
- setFontFamily() : TextProperties
- setFontSize() : ChartWidget
- setFontStyles() : TextProperties
- setForceVector() : AtomTemplate< Molecule_T >, Molecule, RWMolecule
- setForceVectors() : Molecule
- setFormalCharge() : AtomTemplate< Molecule_T >, Molecule, RWMolecule
- setFormalCharges() : Molecule
- setFormat() : GenericHighlighter::Rule
- setFractionalCoordinates() : CrystalTools
- setFrozenAtom() : Molecule
- setFrozenAtomAxis() : Molecule
- setFunctionalName() : GaussianSet
- setGLRenderer() : ToolPlugin
- setGLWidget() : ToolPlugin
- setGreen() : TextProperties
- setHAlign() : TextProperties
- setHallNumber() : Molecule
- setHeterogen() : Residue
- setHybridization() : AtomTemplate< Molecule_T >, Molecule, RWMolecule
- setHybridizations() : Molecule
- setIcon() : ToolPlugin
- setIdentifier() : DefaultModel
- setIdentity() : Camera
- setInputFile() : JobObject
- setInputGeneratorOptions() : BatchJob
- setInputGeneratorScript() : InputGeneratorDialog, InputGeneratorWidget
- setIntegerOption() : JsonWidget
- setInteractive() : RWMolecule
- setInterfaceScript() : InterfaceWidget
- setIsotope() : AtomTemplate< Molecule_T >, Molecule, RWMolecule
- setIsotopes() : Molecule
- setIsoValue() : Mesh
- setItalic() : TextProperties
- setJobTemplate() : MoleQueueWidget
- setLabelText() : TimedProgressDialog
- setLayer() : AtomTemplate< Molecule_T >
- setLegendLocation() : ChartWidget
- setLimits() : Cube
- setLineWidth() : ChartWidget, DashedLineGeometry
- setMask() : EnergyCalculator
- setMinFilter() : Texture2D
- setModelView() : Camera
- setMolecularOrbitalEnergy() : BasisSet
- setMolecularOrbitalNumber() : GaussianSet
- setMolecularOrbitalOccupancy() : BasisSet
- setMolecularOrbitals() : GaussianSet
- setMolecule() : EnergyCalculator, LennardJones, UFF, AtomTyper< OutputType >, BasisSet, InputGeneratorDialog, InputGeneratorWidget, BackgroundFileFormat, ExtensionPlugin, JsonWidget, ToolPlugin, GLWidget
- setMoleQueueOptions() : BatchJob
- setName() : BasisSet, Mesh
- setNormals() : Mesh
- setOpacity() : CylinderGeometry, DashedLineGeometry, LineStripGeometry, MeshGeometry, SphereGeometry, WideLineGeometry
- setOption() : JsonWidget
- setOptionDefaults() : JsonWidget
- setOptions() : FileFormat, InputGenerator
- setOptionsJson() : InterfaceScript
- setOrder() : BondTemplate< Molecule_T >
- setOrthographicScale() : Camera
- setOtherMesh() : Mesh
- setPackageInfo() : PythonScript
- setParent() : Drawable, Node
- setPartialCharges() : Molecule
- setPixelHeight() : TextProperties
- setPixelRatio() : GLRenderer, SolidPipeline
- setPosition2d() : AtomTemplate< Molecule_T >
- setPosition3d() : AtomTemplate< Molecule_T >
- setPositiveColor() : VolumeGeometry
- setPreserveArgb() : QtTextRenderStrategy
- setProgram() : JobObject
- setProjection() : Camera
- setProjectionType() : Camera
- setQuad() : Quad, QuadOutline
- setQueue() : JobObject
- setQueueList() : MoleQueueQueueListModel
- setRadius() : TextLabel3D
- setRadiusScale() : ArrowGeometry
- setRed() : TextProperties
- setRenderPass() : Drawable, GLRenderVisitor
- setResidueColor() : RWMolecule
- setResidueLabel() : Molecule
- setResidueLabels() : Molecule
- setRotationDegreesCW() : TextProperties
- setScene() : ExtensionPlugin
- setScfType() : GaussianSet
- setScriptFilePath() : InputGenerator, InterfaceScript, PythonScript
- setSelected() : AtomTemplate< Molecule_T >
- setShowPoints() : ChartWidget
- setSize() : Graph
- setSource() : Shader
- setSpecification() : CoordinateBlockGenerator
- setSpectra() : Molecule
- setSpinDensityMatrix() : GaussianSet
- setStable() : Mesh
- setStringListOption() : JsonWidget
- setStringOption() : JsonWidget
- setSymmetryLabels() : BasisSet
- setTableOption() : JsonWidget
- setText() : TextLabelBase
- setTextOption() : JsonWidget
- setTextProperties() : TextLabelBase
- setTextRenderStrategy() : GLRenderer, GLRenderVisitor
- setTextureSampler() : ShaderProgram
- setTheoryName() : BasisSet
- setThreshold() : Hdf5DataFormat
- setTickLabels() : ChartWidget
- setTimeStep() : Molecule
- setting() : SpaceGroups
- setTools() : GLWidget
- setType() : Constraint, Shader
- setUnderline() : TextProperties
- setUniformValue() : ShaderProgram
- setUnitCell() : Molecule
- setupWidget() : ScenePlugin
- setUserOptions() : EnergyCalculator
- setVAlign() : TextProperties
- setValue() : Constraint, Cube, Variant, VariantMap, JobObject, TimedProgressDialog
- setVelocities() : Molecule
- setVertices() : Mesh
- setViewport() : Camera
- setVisible() : Drawable, Node
- setVolume() : CrystalTools
- setWrappingS() : Texture2D
- setWrappingT() : Texture2D
- setXAxisLimits() : ChartWidget
- setXAxisTitle() : ChartWidget
- setYAxisLimits() : ChartWidget
- setYAxisTitle() : ChartWidget
- shape() : ElementDetail, ElementItem
- shellTypeFromString() : GUKBasisSet
- show() : TimedProgressDialog
- showAndSelectProgram() : MoleQueueWidget
- showEvent() : InputGeneratorWidget
- size() : Graph, VariantMap, AmbientOcclusionSphereGeometry, CylinderGeometry, SphereGeometry
- size_type : Array< T >
- sizeHint() : ChartDialog
- slater : SlaterSet
- slaterIndices() : SlaterSet
- SlaterSet() : SlaterSet
- smooth() : Mesh
- SolidPipeline() : SolidPipeline
- solidPipeline() : GLRenderer
- source() : Shader
- spacing() : Cube
- specificationUrl() : CjsonFormat, CmlFormat, CMsgPackFormat, DcdFormat, FileFormat, GromacsFormat, LammpsDataFormat, LammpsTrajectoryFormat, MdlFormat, MMTFFormat, OutcarFormat, PdbFormat, PoscarFormat, SdfFormat, TrrFormat, TurbomoleFormat, XyzFormat, GAMESSUSOutput, GaussianCube, GaussianFchk, GenericJson, GenericOutput, MoldenFile, MopacAux, NWChemJson, NWChemLog, ORCAOutput, QCSchema
- spectra() : Molecule
- spectraTypes() : Molecule
- spheres() : AmbientOcclusionSphereGeometry, SphereGeometry
- stable() : Mesh
- subgraph() : Graph
- subgraphCount() : Graph
- subgraphsCount() : Graph
- SubmissionAborted : MoleQueueDialog
- SubmissionAttempted : MoleQueueDialog
- submissionError() : MoleQueueWidget
- SubmissionFailed : MoleQueueDialog
- submissionSuccess() : MoleQueueWidget
- SubmissionSuccessful : MoleQueueDialog
- submitJob() : Client, MoleQueueDialog
- submitJobRequest() : MoleQueueWidget
- submitJobResponse() : Client
- submitNextJob() : BatchJob
- SubmitOption : MoleQueueDialog
- SubmitStatus : MoleQueueDialog
- success() : BackgroundFileFormat
- supportedOperations() : CjsonFormat, CmlFormat, CMsgPackFormat, DcdFormat, FileFormat, GromacsFormat, LammpsDataFormat, LammpsTrajectoryFormat, MdlFormat, MMTFFormat, OutcarFormat, PdbFormat, PoscarFormat, SdfFormat, TrrFormat, TurbomoleFormat, XyzFormat, GAMESSUSOutput, GaussianCube, GaussianFchk, GenericJson, GenericOutput, MoldenFile, MopacAux, NWChemJson, NWChemLog, ORCAOutput, QCSchema
- swapAndPop() : Array< T >
- swapEdgeIndices() : Graph
- swapLayer() : Layer
- swapVertexIndices() : Graph
- symbol() : Elements
- symmetrize() : AvoSpglib
- symmetrizeCell() : RWMolecule
- symmetry() : GaussianSet
- symmetryLabels() : BasisSet